2018年秋季——在梦想成为王，2000年出生的常磐庄吾面前突然出现的时光机。

从这台时光机出现的一位神秘女孩月读告诉他。

“我来自2068年。未来的世界被魔王统治，人们受尽痛苦，创造了一个没有希望的世界。”

为了改变那绝望的未来世界而回到2018年的少女进一步说下去。

“未来的你正是，总归会成为毁灭世界的魔王，时之王者‘Zi-O’。”

命中注定要变身为假面骑士Zi-O的主人公，他真的不是英雄并会变成未来的魔王吗…到底未来的命运会怎样？

这是一个穿越时空，与历代平成假面骑士们相遇同时，过去·现在·未来、为了拯救所有时间而战，成为次代之王的假面骑士故事。