“污秽”是自异世界“祸野”现身，危害人世的怪物。而“阴阳师”长年以来则与污秽战斗至今。

国中生少年·焰魔堂辘轳曾以成为能祓除所有污秽的最强阴阳师为目标，但自从遭遇了“雏月之悲剧”后，他便放弃成为阴阳师。

此时，在这样的辘轤面前，出现了一名少女·化野红绪，这名来自京都的少女，同样以祓除污秽为理想，并展现了惊人的实力……